Dans tout combat, il est important de connaître votre ennemi. Malheureusement, dans notre bataille contre Covid-19, il y a beaucoup de choses que nous ne savons toujours pas. Combien de personnes sont infectées par le virus, y compris celles sans symptômes? Est-ce saisonnier ou dépend des conditions météorologiques? Et comment saurons-nous qu’il peut être sûr de retourner au travail et de renvoyer les enfants à l’école?
CORONAVIRUS – Ce sont des questions importantes. Plus de tests, bien sûr, nous aideront à y répondre. Mais avec des tests en nombre insuffisant dans de nombreuses parties du monde, y compris aux États-Unis, il est impossible de tester tout le monde, du moins pour l’instant.
C’est pourquoi je suis enthousiasmé par un nouveau programme de surveillance des maladies dans la région de Seattle pour détecter les cas de Covid-19 et aider à orienter les réponses de santé publique.
Non seulement cela contribuera à améliorer notre compréhension de l’épidémie de Seattle, mais il fournira également des informations précieuses sur le virus à d’autres communautés du monde entier.
Le Greater Seattle Coronavirus Assessment Network — ou SCAN — est une première plateforme de surveillance des maladies pour Covid-19 qui permet aux participants d’utiliser un test d’auto-écouvillonnage pour collecter leurs propres échantillons nasaux et les envoyer à un laboratoire sans quitter leur maison. En tant que programme de surveillance, le but du SCAN n’est pas de tester chaque personne ou de remplacer les soins médicaux.
Au lieu de cela, SCAN teste un échantillon de personnes dans la région de Seattle, y compris celles qui sont en bonne santé ainsi que celles qui se sentent malades.
Les résultats des tests et d’autres données (comme l’âge, le sexe, la race, le code postal et toute condition de santé sous-jacente d’une personne) sont utilisés par les chercheurs, les modélisateurs de données et les responsables de la santé publique pour brosser un tableau plus clair de l’évolution de Covid-19.
la communauté, qui est le plus à risque, et si les mesures de distance physiques fonctionnent. L’une des plus grandes questions qui déroutent les responsables de la santé publique est exactement combien de personnes sont infectées par le virus.
Pensez à la pandémie comme un iceberg, explique le Dr Jay Shendure, directeur scientifique du Brotman Baty Institute, l’un des principaux partenaires du SCAN. Grâce aux tests médicaux Covid-19 en cours, principalement axés sur les personnes présentant des symptômes, nous avons pu voir la pointe de l’iceberg.
Juste sous la surface, cependant, il y a la partie de l’iceberg que nous ne voyons pas – le nombre inconnu de personnes infectées mais qui présentent des symptômes bénins ou aucun symptôme. Le Dr Shendure compare le SCAN à “un ensemble de pics de sonar où nous survolons l’eau et signalons pour voir ce qui se cache en dessous”.
Je veux être clair que le SCAN ne remplace pas les tests répandus qui sont encore nécessaires dans les communautés. Mais il a le potentiel de devenir un outil important pour les responsables de la santé à la recherche d’informations sur la propagation et le comportement du virus.
Les premiers résultats du SCAN ont révélé de nombreux cas de Covid-19 à Seattle qui, autrement, auraient pu ne pas être détectés chez les personnes ayant présenté certains symptômes (fièvre, toux ou essoufflement) mais n’ayant pas encore consulté un médecin.
Alors que SCAN recueille plus de résultats de test dans les semaines à venir, les chercheurs s’attendent à ce que les nouvelles données donnent une meilleure idée du nombre d’infections et servent de source unique pour aider à répondre à d’autres questions, comme lorsque les mesures de distanciation physique peuvent être assouplies.
SCAN est un partenariat entre Public Health — Seattle & King County, le Brotman Baty Institute, l’Université de Washington Medicine, le Fred Hutchinson Cancer Research Center et le Seattle Children’s Hospital.
Il s’appuie sur le soutien à la modélisation des données de l’Institute for Disease Modeling (IDM) et reçoit le soutien de mon bureau privé, Gates Ventures, et de notre fondation.
SCAN est le prolongement d’une étude commencée avant Covid-19. Il était clair depuis des années qu’il y avait beaucoup de choses que la communauté scientifique ne comprenait pas sur les virus respiratoires, comme la façon dont ils se propageaient à travers une communauté et les meilleures façons de les arrêter.
Ainsi, en 2018, mon bureau s’est associé au Brotman Baty Institute et à d’autres partenaires pour lancer une étude sur les maladies respiratoires, y compris la grippe saisonnière.
Cet effort, la Seattle Flu Study, visait à recruter 10 000 volontaires à Seattle qui ont montré des symptômes du rhume pour fournir un simple écouvillonnage nasal dans les kiosques installés dans les centres de santé et à travers des tests à domicile.
L’une des premières découvertes de l’étude a été l’impact des mesures de distanciation physique à haute intensité sur la réduction de la grippe.
À l’hiver 2019, une importante tempête de neige dans l’État de Washington a entraîné la fermeture d’une semaine d’écoles et de lieux de travail. En analysant les données de cette saison de la grippe, les chercheurs ont découvert que la perturbation dramatique des contacts sociaux causée par la tempête de neige avait entraîné une baisse de la transmission de la grippe et d’autres maladies respiratoires.
L’équipe de l’étude sur la grippe espérait que ces résultats et d’autres aideraient les chercheurs à développer des outils pour freiner et même prévenir la propagation de la grippe – et peut-être un jour aider les responsables de la santé publique à se préparer à une future pandémie.
Ce jour est arrivé plus tôt que quiconque ne l’avait imaginé avec Covid-19. Fin janvier 2020, le premier cas confirmé du nouveau coronavirus est apparu aux États-Unis, juste à l’extérieur de Seattle.
Le patient avait visité Wuhan, en Chine, à l’origine de l’épidémie. Plusieurs semaines plus tard, l’équipe d’étude de la grippe de Seattle a commencé à détecter des signes de signature génétique du coronavirus dans ses échantillons d’enquête sur la grippe.
En février, ils ont identifié le premier cas de transmission connu aux États-Unis – un adolescent vivant en dehors de Seattle qui n’avait pas voyagé en Chine et n’avait aucun lien avec une personne atteinte du virus.
L’équipe d’étude de la grippe a séquencé son génome et s’est rapidement rendu compte que le virus se propageait sans être détecté depuis des semaines. Cette découverte et la découverte de dizaines de cas de coronavirus supplémentaires ont soudainement placé l’étude sur la grippe de Seattle au centre de la réponse de la région au coronavirus.
Nous avons eu la chance de disposer de cette plateforme de surveillance existante et d’une équipe expérimentée pour se concentrer rapidement sur l’épidémie. En mars, nous avons formé le nouveau partenariat SCAN avec l’agence de santé publique du comté de King pour suivre la propagation de Covid-19.
L’une des innovations de SCAN est un kit de test auto-tamponnant facile à utiliser à domicile. Le principal avantage de cette approche de dépistage à domicile est que les gens n’ont pas besoin d’aller dans une clinique où ils risquent de s’exposer ou de s’exposer à d’autres.
Les personnes intéressées à participer au SCAN peuvent s’inscrire en ligne et, une fois approuvées, elles obtiennent un test livré directement à leur domicile. Une fois que les individus ont terminé le test d’écouvillonnage nasal, un service de messagerie le ramasse de leur domicile et le renvoie à SCAN pour traitement.
Toute personne qui obtient un résultat positif est contactée par un agent de santé publique qui lui donne des conseils sur la façon de prendre soin d’elle-même et de sa famille.
Et tous les participants peuvent vérifier leurs résultats en ligne. SCAN teste actuellement 300 personnes par jour, mais travaille activement pour en tester davantage.
Ces résultats de test sont ensuite analysés par des modélisateurs de maladies pour cartographier les chaînes de transmission du virus. En examinant la signature génétique d’une infection, ils peuvent déterminer si elle représente une nouvelle introduction dans la région ou fait partie d’une transmission locale.
Ils peuvent également utiliser les données pour estimer la prévalence de la maladie et construire des modèles pour voir comment le virus réagit à certaines mesures, comme la fermeture des écoles et l’éloignement physique. Vous pouvez en savoir plus sur leurs travaux sur Nextstrain et sur le site de recherche de l’Institute for Disease Modeling.
Au fur et à mesure que l’équipe SCAN recueille plus de données, je suis impatient d’en savoir plus sur leurs points de vue sur bon nombre des questions que nous avons à propos de cette pandémie et sur la manière de prévenir la prochaine.
Maderpost / Bill GATES
